Целью настоящего проекта были разработка и создание электронной публикации о
пресноводных рыбах России на сервере Зоологического института Российской академии
наук в форме интерактивной мультимедийной информационно-поисковой системы.
Создание такого типа информационного
ресурса было продиктовано несколькими причинами.
Основной причиной является необходимость
синтезировать данные по биологическому разнообразию пресноводных рыб обширной
территории России. Следует отметить, что в российской ихтиологии публикации Л.С.
Берга более ста лет являлись настольными книгами для многих поколений ихтиологов.
При этом последнее издание его монографии "Рыбы пресных вод СССР и сопредельных стран"
было опубликовано более 50 лет назад (Берг, 1948, 1949). Сравнительно недавно появились
новые региональные списки и сводки (Богуцкая, Насека, 1996; Павлов и др., 1999; Шейко, Федоров,
2000; Шедько, 2001; Черешнев и др., 2001; Слынько и др., 2001; Sideleva, 2001), но
суммирующей общей ревизии по фауне страны так и не было подготовлено. Не на много лучше
обстоит дело и в европейской ихтиологии. Как отметил в своих работах М. Коттла (Kottelat,
1997, 1998), систематика и номенклатура пресноводных рыб Европы находятся в исключительно
хаотическом состоянии. Этот автор опубликовал предварительный список пресноводных рыб Европы,
но исключая территорию бывшего Советского Союза (Kottelat, 1997). Почти в это же время был
опубликован "Аннотированый каталог круглоротых и рыб континентальных вод России" (1998) и позже,
в 2002 году, "Атлас пресноводных рыб России".
К сожалению, эта очень краткая по объему информации работа несет множество неточностей
фактического, технического и методологического характера. Таким образом, представляется
необходимым привести таксономические данные по пресноводным рыбам России в соответствие
с результатами современных исследований с использованием усовершенствованной методологии.
Другой важной причиной была попытка использования
современных информационных и телекоммуникационных технологий и программного
обеспечения, которые позволили бы представлять данные в различных форматах
(например, тексты, изображения и даже видеоматериалы).
Главной целью технической реализации проекта
было использование преимуществ как базы данных, так и глобальной сети Интернет,
которые имеют много общих свойств. Базы данных поддерживают большие объемы
структурированной информации, могут быстро изменяться, имеют средства управления
данными, содержат метаданные, часто объединены во времени и пространстве,
содержат множественные случаи сходства в структуре информации, а содержащаяся
в базах данных информация может быть отобрана и представлена различными
способами. Интернет может управлять большими объемами информации и имеет
средства манипулировать ими, информация в сети быстро изменяема, востребована
для отбора и представления различными способами, а вэб-страницы содержат
метаданные и часто частично совмещаются во времени и пространстве.
Интегрирование базы данных с вэб-сайтом делает
возможным использование базы данных для опубликования в Интернет, для совмещения
информации и для регулярного обновления вэб-страниц.
Нахождение базы данных "Пресноводные рыбы России" на
сервере Зоологического института предоставит неограниченный доступ всем
заинтересованным пользователям.
Настоящая Информационная Система разработана
как электронная зоологическая монография, основанная на гипербазе данных с
использованием широких возможностей гипертекста. На текущем этапе разработки
наша гипербаза состоит из двух баз данных - таксономической и библиографической.
Основу таксономической базы данных составляет главная
таблица с 36 полями. Информация, депонированная в таксономической базе данных, может
быть разделена на три модуля, или блока: таксономический (научное валидное название,
номенклатура, синонимы, другие названия), географический (ареалы и их изменения из-за
фактов расселения, интродукции или вымирания), морфологический (диагнозы и описания).
Таксономический модуль - центральный модуль в структуре
Информационной Системы. Никто не станет оспаривать тот факт, что идентификация (научное название)
вида должна быть правильной. Информация, относимая к ошибочно определенному виду, фактически
является дезинформацией и вообще не должна быть опубликована. Вопрос о точности идентификации
видов непосредственно касается и неаборигенных видов. В некоторых случаях они плохо известны
или неизвестны местным жителям и даже ихтиологам.
Изменяющийся характер классификаций и научных названий
делает почти невозможным выявление того, под каким названием вида, рода или даже семейства
читатель найдет соответствующую информацию в предшествующей литературе или в коллекциях.
Научные названия изменяются по нескольким причинам, что делает инвентаризацию фауны особенно
сложной, так как информация о каждом отдельном таксоне может быть найдена под несколькими
научными названиями. Эти названия относятся к следующим категориям: валидное названием,
старший синоним, младшие синонимы, новые комбинации (только для видов), а также неправильные
написания или искажения.
Одним из принципов построения нашей ИПС является
возможность быстрого отражения изменяющихся таксономических взглядов. Основная таблица
таксономической базы данных включает специальную систему мнемо- и цифровых кодов
(стандарт ZOOCOD; см. Lobanov, Smirnov, 1997) для компилирования информации по каждому
из этих названий под единственным названием таксона, которое считается валидным на данном
этапе исследований. В случае, если таксономический статус таксона меняется, очень просто
внести необходимое изменение в систему кодов. Это не разрушит связей в комплексе информации,
но она будет привязана уже к новому валидному названию. Соответственно, список родов и видов,
генерируемый из этой таксономической базы на вэб-сайт, будет необходимым образом изменен.
Вэб-сайт разрабатывается параллельно на двух языках -
английском и русском.
Главный вход в ядро сайта, содержащее основную таксономическую
информацию, -
список видов бесчелюстных
и рыб, населяющих пресноводные и солоноватоводные водоемы России.
Истинные морские формы, редко или случайно зарегистрированные в пресных и солоноватых водах, а
также каспийские исключительно морские формы были исключены из списка. Таким образом, он содержит
365 видов (по крайней мере, 380, если включать неописанные виды и виды с неясным статусом),
принадлежащих
145-150 родам,
38 семействами и
14 отрядам. Он отражает взгляд
авторов на таксономию рассматриваемых форм и использование ими филогенетической концепции вида
и включает все недавно описанные виды в фауне России.
Необходимо отметить, что в мире имеются информационные ихтиологические
ресурсы, но несколько иного рода. Например, FISHBASE2000 (Froese, Pauly, 2000), который теперь доступен
on-line в Интернете (
www.fishbase.org). Однако он включает
информацию для всех видов рыб мировой фауны, что, естественно, исключает представление подробных данных
по конкретным отдельным видам.
Известный "Каталог рыб" (Eschmeyer, 1998) также имеет электронную
версию, которая доступна на вэб-сайте Калифорнийской академии наук (
www.calacademy.org/research/ichthyology).
Этот сайт содержит интересную информацию по систематике рыб. Он является одним из лучших ихтиологических
ресурсов в мире. Но опять же, содержание и структура представленной на нем информации принципиально отличны
от того, что запланировано к представлению на нашем сайте, который разрабатывается как региональная
сводка.
Кроме аборигенных видов приводится информация и для неаборигенных
("экзотических") для России видов, натурализовавшихся и не натурализовавшихся в наших водах.
Информация о современном распространении всех видов фауны России дает
представление об истинном масштабе преобразований фауны, вызванных прямым или косвенным влиянием
человеческой деятельности. По нашим данным, число видов, найденных вне пределов их исторических
ареалов (неаборигенных видов), превышает 115. Это число включает случаи преднамеренной акклиматизации,
непреднамеренного вселения, случайного выпуска, естественной инвазии, инвазии, вызванной непреднамеренным
вселением, естественного расселения и так далее.
Содержание и структуру информации, которая будет представлена на
вэб-сайте для каждого вида списка, можно продемонстрировать на примере
Pseudorasbora parva, небольшой
активно расселяющейся карповой рыбы, в настоящее время широко
распространенной в Евразии (../ Cypriniformes/ Cyprinidae/ Gobioninae /Pseudorasbora /..).
Информация по каждому виду будет содержать все компоненты, традиционные
для ихтиологического таксономического обзора: валидное научное название и местные названия, старший синоним
и первоначальное описание с комментариями там, где это необходимо; cинонимы и главные ссылки; диагноз и
детальное морфологическое описание (внешняя морфология, сейсмосенсорная система, структура позвоночника,
череп, окраска, половой диморфизм), связанные гиперссылками с изображением вида и иллюстрациями признаков;
описание ареала, связанное с картой распространения.
Библиографическая база данных создается на основе информационно-поисковой
системы ZOOBIB. Эта система разработана в Зоологическом институте И.С. Смирновым и А.Л. Лобановым (см. Smirnov,
Lobanov, 1997) для среды СУБД FoxPro 2.0/2.5. Система достаточно проста и обладает некоторыми особенностями.
Система имеет удобный интерфейс ввода данных, содержащий три поля ключевых слов (географические названия, общие
термины, названия таксонов); для ввода большого числа ключевых слов, существует дополнительное неограниченное
поле, что позволяет в случае таксономических списков или обзоров фаун вводить названия очень многих таксонов,
иногда до нескольких сотен; просмотр и редактирование имеющихся данных; поиск работ происходит по простым (любой
один признак публикации, например, имя автора или часть слова в названии работы) и сложным запросам (сочетание,
включающее до 16 ключевых слов; запрашиваемый список литературы генерируется на экране или выводится на печать.
Использование принципа ZOOCOD, описанного выше, позволяет пользователю получать информацию по конкретному таксону
независимо от того, какое название из применимых к данному таксону названий использовано в качестве ключевого слова.
Например, информация по озерному гольяну, известному в литературе под 20 разными названиями (от валидного до
искаженных:
Cyprinus perenurus,
Phoxinus jelskii,
Phoxinus stagnalis,
Phoxinus variabilis,
Phoxinus altus,
Phoxinus sabanejewi,
Phoxinus percnurus,
Moroco percnurus,
Eupallasella percnura,
Eupallasella perenurus и др.), может быть
получена при использовании любого из них. Кроме того, принцип ZOOCOD связывает информацию по таксонам более низкого
ранга с таксонами более высокого ранга. При запросе информации для таксона выше ранга вида (род, подсемейство,
семейство) пользователь получит ссылки как по запрашиваемому таксону, так и по таксонам, входящим в него. Например,
при запросе ссылок по Cyprinidae пользователь получит также все ссылки для подсемейств,
родов и видов карповых рыб.
В настоящее время база данных по литературным источникам насчитывает более
7000 наименований. Это лишь малая часть запланированного объема литературы по рыбам пресных вод. Мы предполагаем,
что она будет содержать не менее 20000 наименований, будет переведена на английский язык и будет доступна в режиме
on-line на сервере ЗИН РАН.
В целом, Информационная Система "Пресноводные рыбы России" может
быть эффективным инструментом для обобщения данных из различных областей теоретической и прикладной
ихтиологии, управления природными ресурсами и разработки природоохранных мероприятий.
О САЙТЕ
