Лаборатория териологии
Лаборатория молекулярной систематики
Лаборатория паразитологии
Лаборатория паразитических червей
Лаборатория экспериментальной энтомологии и теоретических основ биометода
Лаборатория пресноводной и экспериментальной гидробиологии
Лаборатория протозоологии
Лаборатория систематики насекомых
Группа по изучению функционирования паразитарных систем в антропогенном ландшафте
Лаборатория морских исследований
Отделение кариосистематики
Лаборатория биосистематических основ интродукции полезных организмов
Лаборатория орнитологии и герпетологии:
Отделение герпетологии
Отделение орнитологии
Отделение электронной микроскопии
Лаборатория солоноватоводной гидробиологии
Лаборатория ихтиологии
Межлабораторная антарктическая группа
Лаборатория эволюционной морфологии
Информационно-издательский отдел
Центр коллективного пользования